Oka Lab Publications

～2007年まで

種	西暦	ﾀｲﾄﾙ	著者	掲載誌	巻、号	頁
原著論文	2007	Ca2+ influx through P2X receptors induces actin cytoskeleton reorganization by the formation of cofilin rods in neurites	K. Homma, Y. Niino, K. Hotta and K. Oka	Molecular and Cellular Neuroscience	accepted
原著論文	2007	Neurite level imaging of living PC12 cell with scanning electrochemical / near-field optical / atomic force microscopy	Akio Ueda, Osamu Niwa, Kenichi Maruyama, Yutaka Shindo, Kotaro Oka and Koji Suzuki	Angewandte Chemie	DOI:10.1002/anie.200
原著論文	2007	Temporal specific optimization of k shortest pathways and network motifs in neuronal signaling cascades	Yoshiya Matsubara, Kyota Ishii, Shinichi Kikuchi, Masahiro Sugimoto, Kotaro Oka and Masaru Tomita	BMC Bioinformatics	in press
原著論文	2007	Algebraic method for the analysis of signaling crosstalk.	Matsubara Y, Kikuchi S, Sugimoto M, Oka K, Tomita M.	Artificial Life	in press
原著論文	2007	Flagella facilitate escape of Salmonella from oncotic 1 macrophages	Gen-ichiro Sano, Yasunari Takada, Shinichi Goto, Kenta Maruyama, Yutaka Shindo, Kotaro Oka, Hidenori Matsui, and Koichi Matsuo	Journal of Bacteriology	in press
原著論文	2007	Brachyury-downstream notochord genes and convergent extension in Ciona intestinalis embryos	K. Hotta , S. Yamada, N. Ueno, N. Satoh and H. Takahashi	Development, Growth and Differentiation	49(5)	373-382
原著論文	2007	A web-based interactive development table for the ascidian Ciona intestinalis, Including 3D real-image embryo reconstructions: I. from fertilized egg to hatching larva	K. Hotta, K. Mitsuhara, H. Takahashi, K. Inaba, K. Oka, Y. Gojobori and K. Ikeo,	Developmental Dynamics	236	1790-1805
総説、解説論文	2007	キンカチョウ音声識別の生物学－社会適応行動の獲得機構－	岡浩太郎	計測と制御	印刷中
総説、解説論文	2007	細胞内マグネシウムイオン濃度を測定する蛍光プローブの開発と細胞機能解析への応用	新藤豊、岡浩太郎、小松広和、鈴木孝治	蛋白質・核酸・酵素（2007）	52（13）	1552-1557
原著論文	2006	Change detection and di¡erence detection of tone duration discrimination	Shuntaro Okazaki, Shin’ichiro Kanoh, KanaTakaura, MinoruTsukada and Kotaro Oka	Neuro Report	17(4)	395-399
原著論文	2006	Serotonin induces the increase in intracellular Ca2+ which enhances neurite outgrowth in PC12 cells via the activation of 5-HT3 receptors and voltage-gated calcium channels	Homma Kohei; Kitamura Yoshiichiro; Ogawa Hiroto; Oka Kotaro	Journal of Neuroscience Research	DOI:10.1002/jnr.20894
総説、解説論文	2006	細胞内シグナル伝達系のシミュレーション技法とイメージング技術	菊地進一、松原嘉哉、矢澤和明、山南春奈、冨田勝、岡浩太郎	シミュレーション	25(1)	29-35
総説、解説論文	2006	マグネシウム蛍光プローブの設計と応用・Ca２＋、Mg２＋マルチ蛍光プローブの開発と多成分同時解析	小松広和、岡浩太郎、鈴木孝治	生物工学会誌	84(5)	173-175
原著論文	2005	Single Molecular Multianalyte (Ca2+, Mg2+) Fluorescent Probe and Applications to Bioimaging	Hirokazu Komatsu, Takahiro Miki, Daniel Citterio, Takeshi Kubota, Yutaka Shindo, Yoshiichiro Kitamura, Kotaro Oka, and Koji Suzuki	J of American Chemical Society	127(31)	10798-10799
原著論文	2005	Influence of mRNA and protein synthesis inhibitors on the long-term memory acquisition of classically conditioned earthworms.	Hikaru Watanabe, Tomohiro Takaya, Toshinobu Shimoia, Hiroto Ogawa, Yoshiichiro Kitamura, Kotaro Oka	Neurobiol. Learning and Memory	83	151-157
原著論文	2005	Inhibiton of RANKL-induced osteoclastogenesis by (-)-DHMEQ, a novel NF-kB inhibitor, through downregulation of NFATc1.	H.Takatsuna, M.Asagiri, T.Kubota, K.Oka, T.Osada, C.Sugiyama, H.Saito, K.Aoki, K.Ohya, H.Takayanagi and K.Umezawa	J. Bone and Miner. Res.	20(4)	653-662
原著論文	2005	Mitochondria are intracellular magnesium stores: investigation by simultaneous fluorescent imagings in PC12 cells	T.Kubota, Y.Shindo, K.Tokuno, H.Komatsu, H.Ogawa, S.Kudo, Y.Kitamura, K.Suzuki and K.Oka	BBA-Molecular Cell Research	1744	19-28
総説、解説論文	2005	機能が同定された感覚性介在ニューロンにおける樹状突起の能動的特性	小川宏人、岡浩太郎	生物物理	45	198-202
学術論文	2005	Zener resonance in a dynamic Wannier-Stark ladder: Two miniband model	Ken-ichi Hino, Kenta Yashima, and Nobuyuki Toshima	Phys. Rev. B 71, 115325
総説、解説論文	2005	E-Neuron：神経細胞におけるシグナル伝達モデル	菊池進一、関山和秀、松原嘉哉、山岡淳子、竹居光太郎、岡浩太郎、冨田勝	日本神経回路学会誌	12	107-112
総説、解説論文	2005	システム生物学-ウェットバイオロジーと計算機科学の接点-	岡浩太郎	情報処理	46	246-253
原著論文	2004	Design and synthesis of high-sensitive and selective fluorescein-derived magnesium fluorescent probes and application to intracellular 3D-Mg2+ imaging.	H.Komatsu, N.Iwasawa, D.Citterio, Y.Suzuki, T.Kubota, K.Tokuno, Y.Kitamura, K.Oka and K.Suzuki	J. Am. Chem. Soc.	126	16353-16360
原著論文	2004	高頻度間欠的振動換気の生体におけるガス交換効率の評価	田中学、伊藤仁、岡浩太郎、谷下一夫、半谷静雄、吉村博邦	日本エム・イー学会生体医工学	42	201-208
原著論文	2004	分岐管気道モデル内振動流に発生する乱れ	田中学、上田義郎、岡庭貴志、岡浩太郎、谷下一夫	日本機械学会論文集B編	70	2057-2064
原著論文	2004	Differences of pO2 peaks of a murine fibrosarcoma between carbon-ion and x-ray irradiation.	T.Fukawa, K.Takematsu K, K.Oka, S.Koike S, K.Ando, H.Kobayashi and K.Tanishita	J. Radiat. Res.	45(2)	303-308
原著論文	2004	Modulation of motor patterns by sensory feedback during earthworm locomotion.	Mizutani K, Shimoi T, Ogawa H, Kitamura Y, Oka K.	Neurosci Res.	48(4)	457-462
原著論文	2004	Directional sensitivity of dendritic calcium responses to wind stimuli in the cricket giant interneuron.	Ogawa H, Baba Y, Oka K.	Neurosci Lett.	358(1)	185-188
総説、解説論文	2004	Mg-Ca蛍光イメージング	久保田健、岡浩太郎	Clinical Calcium	14(8)	1219-1222
総説、解説論文	2004	機能応答性蛍光プローブの開発とバイオイメージングへの応用 -システム生物学のためのバイオイメージング技術-	岡浩太郎	慶應医学	81(2)	79-84
総説、解説論文	2004	第２高調波発生による細胞イメージング～細胞膜電位イメージングを中心に～	岡浩太郎	化学	59(7)	76-77
総説、解説論文	2004	ミミズにおける周期的活動（這行行動）を形成するメカニズムの解明	水谷賢史、岡浩太郎	日本ﾊﾞｲｵメカニズム学会誌	28	18-21
著書	2004	In vivo nitric oxide measurements using a microcoaxial electrode.	Kitamura Y, Kobayashi H, Tanishita K, Oka K.	in Nitric Oxide Protocols Methods Mol Biol.	279	35-44
原著論文	2003	Effect of long-term shear stress exposure on calcium response and morphology of cultured endothelial cells.	S.Kudo, R.Yamaguchi, K.Machida, M.Ikeda, K.Oka, and K.Tanishita	JSME Int. J. series C.	46	1226-1233
原著論文	2003	Kinetic simulation of signal transduction system in hippocampal long-term potentiation with dynamic modeling of protein phosphatase 2A.	Kikuchi S, Fujimoto K, Kitagawa N, Fuchikawa T, Abe M, Oka K, Takei K, Tomita M.	Neural Netw.	16(9)	1389-1398
原著論文	2003	Identification of two types of synaptic activity in the earthworm nervous system during locomotion.	Mizutani K, Shimoi T, Kitamura Y, Ogawa H, Oka K.	Neuroscience	121(2)	473-478
原著論文	2003	Real-time measurement of nitric oxide using a bio-imaging and an electrochemical technique.	Y.Kitamura, H.Ogawa and K.Oka	Talanta	61	717-724
原著論文	2003	Dual responses of tissue partial pressure of oxygen after functional stimulation in rat somatosensory cortex.	K.Masamoto, N.Takizawa, H.Kobayahsi, K.Oka and K.Tanishita	Brain Res.	979(1-2)	104-113
原著論文	2003	Na+/Mg2+ transporter acts as a Mg2+ buffering mechanism in PC12 cells.	Kubota T, Tokuno K, Nakagawa J, Kitamura Y, Ogawa H, Suzuki Y, Suzuki K, Oka K.	Biochem Biophys Res Commun.	303(1)	332-336
総説、解説論文	2003	マグネシウムイオン蛍光分子プローブ	鈴木祥夫、岡浩太郎、鈴木孝治	和光純薬時報	72(3)	2-5
著書	2003	脳機能解明への計算論的アプローチ	太田博道・柳川弘志[編]	生命の科学への招待	三共出版	part IV chapter 1
学術論文	2003	Dynamic quasi-energy-band modulation and exciton effects in biased superlattices driven by a two-color far-infrared field: Disappearance of dynamic localization	Kenta Yashima, Ken-ichi Hino, and Nobuyuki Toshima	Phys. Rev. B 68, 235325

～2007年まで

年月	タイトル	著者	学会
Nov. 12-16, 2006	Mitochondrial magnesium imaging	Y. Shindo, T. Kubota, H. Komatsu, K. Hotta, H. Ogawa, K. Suzuki, K. Oka	Fifth East Asian Biophysics Symposium & Forty-Fourth Anual Meeting of the Biophysical Society of Japan ; Okinawa ,Japan
Oct. 2006	”Theoretical analysis of Oxygen transport and NO diffusion inside microvasculature ”	Kenta Yashima, Kotaro Oka	The 7th International Conference on Systems Biology Japan
Oct 14-18, 2006	Analysis of local translation in growth cones of chick dorsal root ganglia	H. Yamanami, K. Homma, H. Ogawa, K. Hotta, K. Oka	Society for Nueroscience, Atlanta
Oct 14-18, 2006	Peripheral nervous plexuses control squid chromatophore organs	M. Suzuki, T. Kimura, H. Ogawa, H. Aonuma, Y. Kitamura, K. Hotta, K. Oka	Society for Nueroscience, Atlanta
Oct 14-18, 2006	Caenorhabditis elegans is attracted by soy sauce and curving is fundamental strategy to find out its spot on the assay plate	K. Kawamura, K. Oka, K. Hotta	Society for Nueroscience, Atlanta
Oct 14-18, 2006	Simultaneous imaging of dual-FRET using epifluorescence microscopy assisted by computational image ocessing	Y. Niino, K. Hotta and K. Oka	Society for Nueroscience, Atlanta
Oct 14-18, 2006	The assay of partially fixated Caenorhabditis elegans reveals instantaneous odor sensory behavior	Y. Tanahashi T. Yamanaka, K. Hotta, K. Oka	Society for Nueroscience, Atlanta
Oct 14-18, 2006	Alterations of phosphorylation state are associated with memory formation in earthworm	R. Tsuchiya, T. Shimoi, H. Ogawa, K. Hotta, K. Oka	Society for Nueroscience, Atlanta
Feb 18-22, 2006	Computational approaches for regulation of L-type Ca2+ channel by phosphorylation in cardiac myocytes	M. Takahashi, K. Yashima, K. Hotta, K. Oka	The Biophysical Society 2006 Annual Meeting, Salt Lake City, Utah, USA.
Feb 18-22, 2006	Visulalization of Mg2+ release from mitochondria induced by its inner membrane depolarization	Y. Shindo, T. Kubota, H. Komatsu, K. Hotta, H. Ogawa, K. Oka	The Biophysical Society 2006 Annual Meeting, Salt Lake City, Utah, USA.
Feb 18-22, 2006	Measurement of wild-range intracellular　calcium concentration by multi-color imaging technique with plural fluorescent　indicators	T. Iguchi, Y. Niino, K. Hotta, K. Oka	The Biophysical Society 2006 Annual Meeting, Salt Lake City, Utah, USA
Jul 2-7, 2006	Color variants of Galaxeidae monomeric green fluorescent protein for multicolor imaging	Y. Niino, K. Hotta and K. Oka	31st FEBS Congress, Istanbul, Turkey
Dec 10-14, 2005	A FRET-based imaging method of tubulin polymerized state in living cells,	Y. Niino, T. Iguchi and K. Oka	The American Society for Cell Biology 45th Annual Meeting, San Francisco, CA, USA.
Nov. 12-16, 2005	Identification of ling-term memory related neurons in classically conditioned earthworms.	H. Watanabe, R. Tsuchiya, T. Shimoi, H. Ogawa, Y. Kitamura, K. Hotta, K. Oka	Society for Neuroscience, Washington DC, USA
Nov. 12-16, 2005	Analysis of cytoskeletel dynamics of growth cones in chick dorsal root ganglia fluorescent speckle microscopy Society for	H. Yamanami, K. Homma, H. Ogawa, Y. Kitamura, K. Hotta, K. Oka	Society for Neuroscience, Washington DC, USA
Nov. 12-16, 2005	Identification of the central pattern generator of the locomotion in the earthworms	T. Shimoi, K. Mizutani, H. Ogawa, K. Hotta, K. Oka	Society for Neuroscience, Washington DC, USA
Nov. 12-16, 2005	Serotonin inhibitors block short-term but not long-term memory formation in the earthworm	R. Tsuchiya, H. Watanabe, T. Shimoi, H. Ogawa, K. Hotta, K. Oka	Society for Neuroscience, Washington DC, USA
Aug. 200４．	”Simulation of NO mediated control in microvascular system”	Kenta Yashima, Masayuki Takahashi, Yusuke Niino, Yoshiichiro Kitamura, Mayumi Kajimura, Makoto Suematsu, Kotaro Oka	The 5th International Conference on Biological Physics Sweden

kokunai ～2007年まで

青木美菜子、高橋弘樹、岡浩太郎、堀田耕司
CRISP（cysteine-rich secretory protein）superfamilyの比較ゲノム解析
～生体防御物質から毒への進化～
日本進化学会2006年大会、ポスター発表
国立オリンピック記念青少年総合センター（2006年8月29日~31日）

青木美菜子、高橋弘樹、堀田耕司、岡浩太郎
カタユウレイボヤにおけるCAPスーパーファミリー遺伝子群の網羅的特徴付け
日本動物学会関東支部大会、ポスター発表
首都大学（2007年3月24日）

Shindo Yutaka, Kubota Takeshi, Komatsu Hirokazu, Hotta Kohji, Ogawa
Hiroto, Suzuki Koji, Oka Kotaro; 2P521 Mitochondrial magnesium
imaging(52. Bio-imaging,Poster Session,Abstract,Meeting Program of
EABS & BSJ 2006) Biophysics, Vol.46, No.SUPPLEMENT_2(20061001) pp.
S426日本生物物理学会 ISSN:05824052

Oka Kotaro, Fujimura Akira, Hotta Kohji, Ogawa Hiroto; 2P370 Analysis
of vocal communication between mail and female zebra finches(44.
Neuro-biophysics,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ
2006) Biophysics Vol.46, No.SUPPLEMENT_2(20061001) pp. S388
日本生物物理学会 ISSN:05824052

新野祐介、井口崇生、岡浩太郎
FRETを利用した細胞内チューブリンの重合状態の可視化
日本生物物理学会第43回年会、ポスター発表（2005年11月23日-25日）

日野健一，八島健太，戸嶋信幸
強いdcおよびac電場下の動的Wannier-Stark ladderにおけるZener共鳴
日本物理学会(東京理科大学)　2005/3/1


C. elegansの走化性行動の運動学的解析
慶大理工　川村清，堀田耕司，岡浩太郎

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